Пакет: spoa (4.1.4-1)

[ Източник: spoa  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Други пакети, свързани с spoa

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4)

  SIMD partial order alignment library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [не armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  compression library - runtime

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Изтегляне на spoa

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	35,9 кБ	98,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	37,2 кБ	82,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	36,0 кБ	98,0 кБ	[списък на файловете]
armel	34,7 кБ	73,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	34,0 кБ	61,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	37,7 кБ	82,0 кБ	[списък на файловете]
i386	37,8 кБ	77,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	41,3 кБ	106,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	35,9 кБ	73,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	36,3 кБ	100,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	37,1 кБ	98,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	37,7 кБ	98,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	35,9 кБ	70,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	37,1 кБ	78,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	38,5 кБ	97,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	34,8 кБ	1 060,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	37,0 кБ	77,0 кБ	[списък на файловете]