Пакет: snpomatic (1.0-7 и други)

[ Източник: snpomatic  ]

fast, stringent short-read mapping software

High throughput sequencing technologies generate large amounts of short reads. Mapping these to a reference sequence consumes large amounts of processing time and memory, and read mapping errors can lead to noisy or incorrect alignments.

SNP-o-matic is a fast, stringent short-read mapping software. It supports a multitude of output types and formats, for uses in filtering reads, alignments, sequence-based genotyping calls, assisted reassembly of contigs etc.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

Други пакети, свързани с snpomatic

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не ia64]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Изтегляне на snpomatic

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.0-7	76,0 кБ	217,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.0-7	83,6 кБ	208,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.0-7	71,6 кБ	216,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.0-7	66,4 кБ	167,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.0-7	67,5 кБ	127,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1.0-7	76,0 кБ	180,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.0-7	85,9 кБ	211,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.0-5	106,7 кБ	393,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.0-7	73,6 кБ	183,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.0-7	74,8 кБ	222,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.0-7	80,1 кБ	280,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.0-7	82,2 кБ	216,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.0-7	77,9 кБ	156,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.0-7	79,3 кБ	204,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.0-7	90,2 кБ	215,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.0-7	67,5 кБ	1 050,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1.0-7	83,3 кБ	199,0 кБ	[списък на файловете]