всички настройки
stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Източник: pirs  ]

Пакет: pirs (2.0.2+dfsg-8 и други)

Връзки за pirs

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник pirs.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

Profile based Illumina pair-end Reads Simulator

The program pIRS can be used for simulating Illumina PE reads, with a series of characters generated by Illumina sequencing platform, such as insert size distribution, sequencing error(substitution, insertion, deletion), quality score and GC content-coverage bias.

The insert size follows a normal distribution, so users should set the mean value and standard deviation. Usually the standard deviation is set as 1/20 of the mean value. The normal distribution by Box-Muller method is simulated.

The program simulates sequencing error, quality score and GC content- coverage bias according to the empirical distribution profile. Some default profiles counted from lots of real sequencing data are provided.

To simulate reads from diploid genome, users should simulate the diploid genome sequence firstly by setting the ratio of heterozygosis SNP, heterozygosis InDel and structure variation.

Други пакети, свързани с pirs

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на pirs

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Версия Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 2.0.2+dfsg-8 110,7 кБ397,0 кБ [списък на файловете]
amd64 2.0.2+dfsg-8 109,7 кБ375,0 кБ [списък на файловете]
arm64 2.0.2+dfsg-8 101,6 кБ351,0 кБ [списък на файловете]
armel 2.0.2+dfsg-8 98,6 кБ337,0 кБ [списък на файловете]
armhf 2.0.2+dfsg-8 98,4 кБ293,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 2.0.2+dfsg-8 112,6 кБ365,0 кБ [списък на файловете]
hurd-i386 2.0.2+dfsg-7 117,1 кБ373,0 кБ [списък на файловете]
i386 2.0.2+dfsg-8 117,0 кБ381,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-amd64 2.0.2+dfsg-8 109,5 кБ367,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-i386 2.0.2+dfsg-8 117,0 кБ377,0 кБ [списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура) 2.0.2+dfsg-8 109,1 кБ377,0 кБ [списък на файловете]
mips 2.0.2+dfsg-8 111,5 кБ403,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 2.0.2+dfsg-8 111,4 кБ418,0 кБ [списък на файловете]
mipsel 2.0.2+dfsg-8 112,6 кБ403,0 кБ [списък на файловете]
powerpcspe (неофициална архитектура) 2.0.2+dfsg-8 109,9 кБ417,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 2.0.2+dfsg-8 113,0 кБ483,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 2.0.2+dfsg-8 112,4 кБ419,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 (неофициална архитектура) 2.0.2+dfsg-8 105,6 кБ324,0 кБ [списък на файловете]
s390x 2.0.2+dfsg-8 101,5 кБ367,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 2.0.2+dfsg-8 123,0 кБ366,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 2.0.2+dfsg-8 99,3 кБ360,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 2.0.2+dfsg-6 110,1 кБ377,0 кБ [списък на файловете]