Пакет: phyx (1.3.1+ds-2 и други)

[ Източник: phyx  ]

UNIX-style phylogenetic analyses on trees and sequences

phyx provides a convenient, lightweight and inclusive toolkit consisting of programs spanning the wide breadth of programs utilized by researchers performing phylogenomic analyses. Modeled after Unix/GNU/Linux command line tools, individual programs perform a single task and operate on standard I/O streams. A result of this stream-centric approach is that, for most programs, only a single sequence or tree is in memory at any moment. Thus, large datasets can be processed with minimal memory requirements. phyx’s ever-growing complement of programs consists of over 35 programs focused on exploring, manipulating, analyzing and simulating phylogenetic objects (alignments, trees and MCMC logs). As with standard Unix command line tools, these programs can be piped (together with non-phyx tools), allowing the easy construction of efficient analytical pipelines.

Други пакети, свързани с phyx

• dep: libarmadillo12 (>= 1:12.6.1+dfsg) [не riscv64, sparc64]

  streamlined C++ linear algebra library

  dep: libarmadillo12 (>= 1:12.6.4+dfsg) [sparc64]

  dep: libarmadillo12 (>= 1:12.6.7+dfsg) [riscv64]

• dep: libblas3 [sparc64]

  Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

  или libblas.so.3

  виртуален пакет, предлаган от libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [не arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, riscv64, sh4]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: liblapack3 [sparc64]

  Library of linear algebra routines 3 - shared version

  или liblapack.so.3

  виртуален пакет, предлаган от libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libnlopt0 (>= 2.6.1)

  nonlinear optimization library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не alpha]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.2.0-2) [alpha]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

Изтегляне на phyx

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.3.1+ds-2+b1	2 174,1 кБ	23 920,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.3.1+ds-2+b1	2 221,7 кБ	20 547,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.3.1+ds-2+b1	2 072,8 кБ	20 811,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.3.1+ds-2+b1	1 821,2 кБ	18 150,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.3.1+ds-2+b1	1 778,4 кБ	12 934,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1.3.1+ds-2+b1	1 952,2 кБ	18 577,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.3.1+ds-2+b1	2 358,6 кБ	21 466,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.3.1+ds-2+b1	2 064,4 кБ	19 354,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.3.1+ds-2+b1	2 184,3 кБ	26 333,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.3.1+ds-2+b1	2 149,0 кБ	26 763,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.3.1+ds-2+b1	2 148,8 кБ	25 099,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.3.1+ds-2+b1	2 080,8 кБ	15 663,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.3.1+ds-2+b1	2 089,5 кБ	21 411,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.3.1+ds-2+b1	2 204,1 кБ	20 189,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.3.1+ds-2	2 101,7 кБ	52 823,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1.3.1+ds-2+b1	2 183,2 кБ	19 418,0 кБ	[списък на файловете]