всички настройки
stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Източник: physamp  ]

Пакет: physamp (1.1.0-1)

Връзки за physamp


Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник physamp.


Външни препратки:

Подобни пакети:

sample sequence alignment corresponding to phylogeny

The PhySamp package currently contains two programs: bppphysamp, which samples sequences according to their similarity, and bppalnoptim, which samples a sequence alignment by removing sequences in order to maximize the number of sites suitable for a given analysis. The bppalnoptim program has three running modes:

 * Interactive: the user will be iteratively proposed a set of choices
   for sequence removal, with their corresponding site gains. The
   procedure stops when the user does not want to remove more sequences,
   and the resulting filtered alignment is written.
 * Automatic: the user enters an a priori criterion for stopping
   the filtering procedure (for instance a minimum number of
   sequences to keep).
 * Diagnostic: this mode allows one to plot the trade-off curve, by
   showing the site gain as a function of the number of removed

Други пакети, свързани с physamp

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на physamp

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 266,0 кБ504,0 кБ [списък на файловете]
amd64 264,9 кБ466,0 кБ [списък на файловете]
arm64 260,4 кБ458,0 кБ [списък на файловете]
armel 252,5 кБ420,0 кБ [списък на файловете]
armhf 253,1 кБ380,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 270,3 кБ491,0 кБ [списък на файловете]
hurd-i386 266,4 кБ444,0 кБ [списък на файловете]
i386 268,6 кБ452,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-amd64 262,2 кБ454,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-i386 266,3 кБ444,0 кБ [списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура) 259,5 кБ436,0 кБ [списък на файловете]
mips 260,3 кБ477,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 261,0 кБ501,0 кБ [списък на файловете]
mipsel 261,3 кБ481,0 кБ [списък на файловете]
powerpcspe (неофициална архитектура) 264,2 кБ548,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 268,2 кБ614,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 266,6 кБ550,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 (неофициална архитектура) 260,8 кБ427,0 кБ [списък на файловете]
s390x 258,9 кБ474,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 274,1 кБ445,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 255,5 кБ459,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 264,3 кБ436,0 кБ [списък на файловете]