Пакет: openbabel (3.1.1+dfsg-9 и други)

[ Източник: openbabel  ]

Chemical toolbox utilities (cli)

Open Babel is a chemical toolbox designed to speak the many languages of chemical data. It allows one to search, convert, analyze, or store data from molecular modeling, chemistry, solid-state materials, biochemistry, or related areas. Features include:

 * Hydrogen addition and deletion
 * Support for Molecular Mechanics
 * Support for SMARTS molecular matching syntax
 * Automatic feature perception (rings, bonds, hybridization, aromaticity)
 * Flexible atom typer and perception of multiple bonds from atomic coordinates
 * Gasteiger-Marsili partial charge calculation

File formats Open Babel supports include PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC and MPQC.

This package includes the following utilities:

 * obabel: Convert between various chemical file formats
 * obenergy: Calculate the energy for a molecule
 * obminimize: Optimize the geometry, minimize the energy for a molecule
 * obgrep: Molecular search program using SMARTS pattern
 * obgen: Generate 3D coordinates for a molecule
 * obprop: Print standard molecular properties
 * obfit: Superimpose two molecules based on a pattern
 * obrotamer: Generate conformer/rotamer coordinates
 * obconformer: Generate low-energy conformers
 * obchiral: Print molecular chirality information
 * obrotate: Rotate dihedral angle of molecules in batch mode
 * obprobe: Create electrostatic probe grid

Етикети: Field: Chemistry, Implemented in: C++, User Interface: interface::commandline, role::program, Scope: Utility, Purpose: Data Conversion

Други пакети, свързани с openbabel

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [sparc64]

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libopenbabel7 (>= 3.1.1+dfsg)

  Chemical toolbox library

• dep: libstdc++6 (>= 11) [ia64, sh4]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не ia64, sh4]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Изтегляне на openbabel

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	3.1.1+dfsg-9+b4	125,5 кБ	1 453,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	3.1.1+dfsg-9+b8	124,7 кБ	636,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	3.1.1+dfsg-9+b8	116,6 кБ	1 389,0 кБ	[списък на файловете]
armel	3.1.1+dfsg-9+b8	118,6 кБ	502,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	3.1.1+dfsg-9+b8	118,8 кБ	466,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	3.1.1+dfsg-9+b8	131,2 кБ	565,0 кБ	[списък на файловете]
i386	3.1.1+dfsg-9+b8	127,6 кБ	613,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	3.1.1+dfsg-9	136,3 кБ	731,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	3.1.1+dfsg-9+b1	131,6 кБ	573,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	3.1.1+dfsg-9+b9	123,0 кБ	1 408,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	3.1.1+dfsg-9+b8	123,1 кБ	1 471,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	3.1.1+dfsg-9+b8	123,4 кБ	1 453,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	3.1.1+dfsg-9+b5	124,8 кБ	521,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	3.1.1+dfsg-9+b8	123,2 кБ	556,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	3.1.1+dfsg-9	140,6 кБ	1 368,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	3.1.1+dfsg-9+b8	122,9 кБ	19 660,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	3.1.1+dfsg-9+b1	122,7 кБ	590,0 кБ	[списък на файловете]