всички настройки
stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Източник: murasaki  ]

Пакет: murasaki-mpi (1.68.6-8 и други)

Връзки за murasaki-mpi

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник murasaki.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

This package provides the MPI-enabled binary for murasaki. While this will speed up operation on multi-processor machines it will slow down on a single processor.

Други пакети, свързани с murasaki-mpi

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на murasaki-mpi

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Версия Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 1.68.6-8+b1 603,6 кБ4 393,0 кБ [списък на файловете]
amd64 1.68.6-8+b1 614,8 кБ4 026,0 кБ [списък на файловете]
arm64 1.68.6-8+b1 548,8 кБ3 862,0 кБ [списък на файловете]
armel 1.68.6-8+b1 409,1 кБ2 680,0 кБ [списък на файловете]
armhf 1.68.6-8+b1 417,4 кБ2 024,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 1.68.6-8+b1 600,9 кБ4 033,0 кБ [списък на файловете]
hurd-i386 1.68.6-8+b1 622,0 кБ3 836,0 кБ [списък на файловете]
i386 1.68.6-8+b1 625,1 кБ3 900,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-amd64 1.68.6-8+b1 605,8 кБ3 970,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-i386 1.68.6-8+b1 622,0 кБ3 840,0 кБ [списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура) 1.68.6-8+b1 522,3 кБ3 372,0 кБ [списък на файловете]
mips 1.68.6-8+b1 562,1 кБ4 503,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 1.68.6-8+b1 594,4 кБ5 157,0 кБ [списък на файловете]
mipsel 1.68.6-8+b1 581,4 кБ4 503,0 кБ [списък на файловете]
powerpcspe (неофициална архитектура) 1.68.6-8+b1 528,8 кБ4 171,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 1.68.6-8+b1 612,3 кБ5 778,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 1.68.6-8+b1 618,2 кБ5 074,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 (неофициална архитектура) 1.68.6-8+b1 565,6 кБ3 350,0 кБ [списък на файловете]
s390x 1.68.6-8+b1 548,8 кБ4 358,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 1.68.6-8+b1 553,9 кБ3 270,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 1.68.6-8+b1 520,2 кБ4 053,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 1.68.6-8 564,0 кБ3 427,0 кБ [списък на файловете]