всички настройки
jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Източник: mummer  ]

Пакет: mummer (3.23+dfsg-4)

Връзки за mummer

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник mummer.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

Efficient sequence alignment of full genomes

MUMmer is a system for rapidly aligning entire genomes, whether in complete or draft form. For example, MUMmer 3.0 can find all 20-basepair or longer exact matches between a pair of 5-megabase genomes in 13.7 seconds, using 78 MB of memory, on a 2.4 GHz Linux desktop computer. MUMmer can also align incomplete genomes; it handles the 100s or 1000s of contigs from a shotgun sequencing project with ease, and will align them to another set of contigs or a genome using the NUCmer program included with the system. If the species are too divergent for DNA sequence alignment to detect similarity, then the PROmer program can generate alignments based upon the six-frame translations of both input sequences.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::TODO, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Други пакети, свързани с mummer

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на mummer

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 799,5 кБ2 037,0 кБ [списък на файловете]
amd64 789,6 кБ1 912,0 кБ [списък на файловете]
arm64 770,4 кБ1 828,0 кБ [списък на файловете]
armel 760,7 кБ1 747,0 кБ [списък на файловете]
armhf 759,5 кБ1 507,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 795,2 кБ1 848,0 кБ [списък на файловете]
i386 793,9 кБ1 891,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-amd64 788,6 кБ1 908,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-i386 793,6 кБ1 891,0 кБ [списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура) 769,7 кБ1 819,0 кБ [списък на файловете]
mips 788,9 кБ2 014,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 796,8 кБ2 148,0 кБ [списък на файловете]
mipsel 793,6 кБ2 018,0 кБ [списък на файловете]
powerpcspe (неофициална архитектура) 779,2 кБ2 555,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 791,5 кБ2 765,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 798,9 кБ2 701,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 (неофициална архитектура) 780,7 кБ1 669,0 кБ [списък на файловете]
s390x 770,1 кБ1 960,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 803,5 кБ1 743,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 759,4 кБ1 895,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 785,2 кБ1 811,0 кБ [списък на файловете]