всички настройки
stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Източник: miniasm  ]

Пакет: miniasm (0.3+dfsg-1)

Връзки за miniasm

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник miniasm.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Етикети: Biology: Nucleic Acids, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, Role: role::program, science::calculation, Purpose: Calculating, use::comparing, works-with::biological-sequence

Други пакети, свързани с miniasm

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на miniasm

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 31,7 кБ83,0 кБ [списък на файловете]
amd64 29,7 кБ70,0 кБ [списък на файловете]
arm64 27,5 кБ66,0 кБ [списък на файловете]
armel 28,0 кБ66,0 кБ [списък на файловете]
armhf 26,7 кБ54,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 29,9 кБ67,0 кБ [списък на файловете]
hurd-i386 31,8 кБ74,0 кБ [списък на файловете]
i386 32,0 кБ74,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-amd64 29,6 кБ70,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-i386 31,8 кБ74,0 кБ [списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура) 26,0 кБ66,0 кБ [списък на файловете]
mips 30,2 кБ77,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 30,2 кБ78,0 кБ [списък на файловете]
mipsel 30,1 кБ77,0 кБ [списък на файловете]
powerpcspe (неофициална архитектура) 28,5 кБ82,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 32,5 кБ147,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 32,8 кБ83,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 (неофициална архитектура) 28,4 кБ55,0 кБ [списък на файловете]
s390x 28,2 кБ74,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 29,3 кБ58,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 26,6 кБ68,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 29,4 кБ70,0 кБ [списък на файловете]