всички настройки
stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Източник: mauve-aligner  ]

Пакет: mauve-aligner (2.4.0+4736-2)

Връзки за mauve-aligner

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник mauve-aligner.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

multiple genome alignment

Mauve is a system for efficiently constructing multiple genome alignments in the presence of large-scale evolutionary events such as rearrangement and inversion. Multiple genome alignment provides a basis for research into comparative genomics and the study of evolutionary dynamics. Aligning whole genomes is a fundamentally different problem than aligning short sequences.

Mauve has been developed with the idea that a multiple genome aligner should require only modest computational resources. It employs algorithmic techniques that scale well in the amount of sequence being aligned. For example, a pair of Y. pestis genomes can be aligned in under a minute, while a group of 9 divergent Enterobacterial genomes can be aligned in a few hours.

Mauve computes and interactively visualizes genome sequence comparisons. Using FastA or GenBank sequence data, Mauve constructs multiple genome alignments that identify large-scale rearrangement, gene gain, gene loss, indels, and nucleotide substutition.

Mauve is developed at the University of Wisconsin.

Други пакети, свързани с mauve-aligner

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на mauve-aligner

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
amd64 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
arm64 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
armel 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
armhf 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
i386 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-amd64 482,5 кБ548,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-i386 482,5 кБ548,0 кБ [списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура) 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
mips 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
mipsel 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
powerpcspe (неофициална архитектура) 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 (неофициална архитектура) 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
s390x 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 480,0 кБ545,0 кБ [списък на файловете]