всички настройки
buster  ] [  sid  ]
[ Източник: grabix  ]

Пакет: grabix (0.1.7-1)

Връзки за grabix

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник grabix.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

wee tool for random access into BGZF files

In biomedical research it is increasing practice to study the genetic basis of disease. This now frequently comprises the sequencing of human sequences. The output of the machine however is redundant, and the real sequence is the best sequence to explain the redundancy. The exchange of data happens only with compressed files - to huge and redundant to perform otherwise. One should avoid uncompression whenever possible.

grabix leverages the fantastic BGZF library of the samtools package to provide random access into text files that have been compressed with bgzip. grabix creates it's own index (.gbi) of the bgzipped file. Once indexed, one can extract arbitrary lines from the file with the grab command. Or choose random lines with the, well, random command.

Други пакети, свързани с grabix

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на grabix

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 14,9 кБ52,0 кБ [списък на файловете]
amd64 14,5 кБ56,0 кБ [списък на файловете]
arm64 13,8 кБ52,0 кБ [списък на файловете]
armel 14,8 кБ47,0 кБ [списък на файловете]
armhf 14,2 кБ43,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 16,7 кБ52,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-amd64 14,4 кБ52,0 кБ [списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура) 32,9 кБ70,0 кБ [списък на файловете]
mips 15,9 кБ52,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 14,9 кБ53,0 кБ [списък на файловете]
mipsel 16,0 кБ52,0 кБ [списък на файловете]
powerpcspe (неофициална архитектура) 33,5 кБ110,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 15,1 кБ92,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 14,8 кБ92,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 (неофициална архитектура) 13,9 кБ48,0 кБ [списък на файловете]
s390x 13,7 кБ52,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 34,1 кБ70,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 13,5 кБ54,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 14,5 кБ55,0 кБ [списък на файловете]