всички настройки
stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Източник: fastml  ]

Пакет: fastml (3.1-4)

Връзки за fastml


Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник fastml.


Външни препратки:

Подобни пакети:

maximum likelihood ancestral amino-acid sequence reconstruction

FastML is a bioinformatics tool for the reconstruction of ancestral sequences based on the phylogenetic relations between homologous sequences. FastML runs several algorithms that reconstruct the ancestral sequences with emphasis on an accurate reconstruction of both indels and characters. For character reconstruction the previously described FastML algorithms are used to efficiently infer the most likely ancestral sequences for each internal node of the tree. Both joint and the marginal reconstructions are provided. For indels reconstruction the sequences are first coded according to the indel events detected within the multiple sequence alignment (MSA) and then a state-of-the-art likelihood model is used to reconstruct ancestral indels states. The results are the most probable sequences, together with posterior probabilities for each character and indel at each sequence position for each internal node of the tree. FastML is generic and is applicable for any type of molecular sequences (nucleotide, protein, or codon sequences).

Други пакети, свързани с fastml

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на fastml

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 878,1 кБ4 343,0 кБ [списък на файловете]
amd64 920,1 кБ3 582,0 кБ [списък на файловете]
arm64 822,3 кБ3 266,0 кБ [списък на файловете]
armel 759,2 кБ3 167,0 кБ [списък на файловете]
armhf 764,0 кБ2 175,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 825,0 кБ3 409,0 кБ [списък на файловете]
hurd-i386 957,7 кБ3 723,0 кБ [списък на файловете]
i386 951,2 кБ3 699,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-amd64 922,2 кБ3 582,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-i386 951,0 кБ3 683,0 кБ [списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура) 800,7 кБ3 279,0 кБ [списък на файловете]
mips 779,6 кБ4 170,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 788,7 кБ4 279,0 кБ [списък на файловете]
mipsel 799,2 кБ4 170,0 кБ [списък на файловете]
powerpcspe (неофициална архитектура) 846,1 кБ3 865,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 872,3 кБ4 378,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 897,4 кБ4 186,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 (неофициална архитектура) 869,6 кБ2 587,0 кБ [списък на файловете]
s390x 797,9 кБ3 818,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 1 063,8 кБ3 259,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 723,7 кБ3 443,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 924,1 кБ3 463,0 кБ [списък на файловете]