всички настройки
buster  ] [  sid  ]
[ Източник: estscan  ]

Пакет: estscan (3.0.3-3 и други)

Връзки за estscan


Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник estscan.


Външни препратки:

Подобни пакети:

ORF-independent detector of coding DNA sequences

ESTScan is a program that can detect coding regions in DNA sequences, even if they are of low quality. ESTScan will also detect and correct sequencing errors that lead to frameshifts. ESTScan is not a gene prediction program , nor is it an open reading frame detector. In fact, its strength lies in the fact that it does not require an open reading frame to detect a coding region. As a result, the program may miss a few translated amino acids at either the N or the C terminus, but will detect coding regions with high selectivity and sensitivity.

ESTScan takes advantages of the bias in hexanucleotide usage found in coding regions relative to non-coding regions. This bias is formalized as an inhomogeneous 3-periodic fifth-order Hidden Markov Model (HMM). Additionally, the HMM of ESTScan has been extended to allows insertions and deletions when these improve the coding region statistics.

Други пакети, свързани с estscan

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на estscan

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Версия Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 3.0.3-3 47,1 кБ195,0 кБ [списък на файловете]
amd64 3.0.3-3 43,3 кБ187,0 кБ [списък на файловете]
arm64 3.0.3-3 42,1 кБ175,0 кБ [списък на файловете]
armel 3.0.3-3 42,6 кБ175,0 кБ [списък на файловете]
armhf 3.0.3-3 40,7 кБ159,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 3.0.3-3 43,8 кБ176,0 кБ [списък на файловете]
hurd-i386 3.0.3-3 43,2 кБ175,0 кБ [списък на файловете]
i386 3.0.3-3 43,5 кБ187,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-amd64 3.0.3-3 43,4 кБ175,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-i386 3.0.3-3 43,4 кБ175,0 кБ [списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура) 3.0.3-3 41,2 кБ175,0 кБ [списък на файловете]
mips 3.0.3-3 42,9 кБ174,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 3.0.3-3 44,7 кБ192,0 кБ [списък на файловете]
mipsel 3.0.3-3 43,1 кБ174,0 кБ [списък на файловете]
powerpcspe (неофициална архитектура) 3.0.3-3 41,8 кБ367,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 3.0.3-3 45,9 кБ371,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 3.0.3-3 45,5 кБ371,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 (неофициална архитектура) 3.0.3-3 41,6 кБ167,0 кБ [списък на файловете]
s390x 3.0.3-3 42,9 кБ179,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 3.0.3-3 45,6 кБ163,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 3.0.3-3 42,1 кБ180,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 3.0.3-2 41,4 кБ179,0 кБ [списък на файловете]