Пакет: disulfinder (1.2.11-12 и други)

[ Източник: disulfinder  ]

cysteines disulfide bonding state and connectivity predictor

'disulfinder' is for predicting the disulfide bonding state of cysteines and their disulfide connectivity starting from sequence alone. Disulfide bridges play a major role in the stabilization of the folding process for several proteins. Prediction of disulfide bridges from sequence alone is therefore useful for the study of structural and functional properties of specific proteins. In addition, knowledge about the disulfide bonding state of cysteines may help the experimental structure determination process and may be useful in other genomic annotation tasks.

'disulfinder' predicts disulfide patterns in two computational stages: (1) the disulfide bonding state of each cysteine is predicted by a BRNN-SVM binary classifier; (2) cysteines that are known to participate in the formation of bridges are paired by a Recursive Neural Network to obtain a connectivity pattern.

Етикети: Role: Program

Други пакети, свързани с disulfinder

• dep: disulfinder-data

  data files for predictor of disulfide bonds in proteins

• dep: libc6 (>= 2.33) [не alpha, ia64, riscv64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.33) [alpha, ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 11) [не riscv64]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Изтегляне на disulfinder

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.2.11-12	223,7 кБ	773,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.2.11-12	233,3 кБ	676,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.2.11-12	200,7 кБ	588,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.2.11-12	185,2 кБ	567,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.2.11-12	190,6 кБ	411,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1.2.11-12	214,0 кБ	606,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.2.11-12	242,0 кБ	707,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.2.11-12	296,9 кБ	1 363,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.2.11-12	209,3 кБ	619,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.2.11-12	203,5 кБ	744,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.2.11-12	227,5 кБ	828,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.2.11-12	236,6 кБ	764,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.2.11-12+b1	226,4 кБ	508,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.2.11-12	203,5 кБ	676,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.2.11-12	262,2 кБ	584,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.2.11-12	183,4 кБ	609,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1.2.11-12	232,1 кБ	635,0 кБ	[списък на файловете]