всички настройки
jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Източник: clonalframe  ]

Пакет: clonalframe (1.2-9)

Връзки за clonalframe

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник clonalframe.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

inference of bacterial microevolution using multilocus sequence data

ClonalFrame identifies the clonal relationships between the members of a sample, while also estimating the chromosomal position of homologous recombination events that have disrupted the clonal inheritance.

ClonalFrame can be applied to any kind of sequence data, from a single fragment of DNA to whole genomes. It is well suited for the analysis of MLST data, where 7 gene fragments have been sequenced, but becomes progressively more powerful as the sequenced regions increase in length and number up to whole genomes. However, it requires the sequences to be aligned. If you have genomic data that is not aligned, it is recommend to use Mauve which produces alignment of whole bacterial genomes in exactly the format required for analysis with ClonalFrame.

Етикети: Implemented in: C++, Role: Program

Други пакети, свързани с clonalframe

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на clonalframe

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 51,7 кБ148,0 кБ [списък на файловете]
amd64 48,6 кБ127,0 кБ [списък на файловете]
arm64 44,0 кБ115,0 кБ [списък на файловете]
armel 41,9 кБ110,0 кБ [списък на файловете]
armhf 40,7 кБ82,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 53,1 кБ137,0 кБ [списък на файловете]
hurd-i386 52,5 кБ126,0 кБ [списък на файловете]
i386 52,5 кБ126,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-amd64 48,5 кБ123,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-i386 52,5 кБ126,0 кБ [списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура) 46,7 кБ122,0 кБ [списък на файловете]
mips 51,4 кБ145,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 53,0 кБ159,0 кБ [списък на файловете]
mipsel 52,0 кБ145,0 кБ [списък на файловете]
powerpcspe (неофициална архитектура) 49,5 кБ146,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 52,5 кБ211,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 52,5 кБ147,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 (неофициална архитектура) 48,3 кБ104,0 кБ [списък на файловете]
s390x 46,1 кБ131,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 53,0 кБ115,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 43,4 кБ126,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 48,0 кБ118,0 кБ [списък на файловете]