всички настройки
jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Източник: bowtie  ]

Пакет: bowtie (1.2.2+dfsg-4 и други)

Връзки за bowtie


Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник bowtie.


Външни препратки:

Подобни пакети:

Ultrafast memory-efficient short read aligner

This package addresses the problem to interpret the results from the latest (2010) DNA sequencing technologies. Those will yield fairly short stretches and those cannot be interpreted directly. It is the challenge for tools like Bowtie to give a chromosomal location to the short stretches of DNA sequenced per run.

Bowtie aligns short DNA sequences (reads) to the human genome at a rate of over 25 million 35-bp reads per hour. Bowtie indexes the genome with a Burrows-Wheeler index to keep its memory footprint small: typically about 2.2 GB for the human genome (2.9 GB for paired-end).

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Наука: science::calculation, scope::utility, Purpose: Analysing, use::comparing, works-with::biological-sequence

Други пакети, свързани с bowtie

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на bowtie

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Версия Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 1.2.2+dfsg-4 1 428,8 кБ9 007,0 кБ [списък на файловете]
amd64 1.2.2+dfsg-4 1 631,2 кБ7 087,0 кБ [списък на файловете]
arm64 1.2.2+dfsg-4 1 244,6 кБ6 387,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 1.0.0-6 894,0 кБ3 548,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-amd64 1.1.2-6 1 530,0 кБ6 745,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 1.2.2+dfsg-4 1 063,7 кБ8 065,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 1.2.2+dfsg-4 1 349,2 кБ8 611,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 1.2.2+dfsg-4 1 390,0 кБ8 415,0 кБ [списък на файловете]
s390x 1.2.2+dfsg-4 1 356,3 кБ7 111,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 1.0.0-6 860,1 кБ3 077,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 1.2.2+dfsg-4 1 158,0 кБ6 995,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 1.0.1-2 878,8 кБ3 264,0 кБ [списък на файловете]