всички настройки
jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Източник: seqtools  ]

Пакет: belvu (4.44.1+dfsg-3)

Връзки за belvu


Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник seqtools.


Външни препратки:

Подобни пакети:

multiple sequence alignment viewer and phylogenetic tool

Belvu is a multiple sequence alignment viewer and phylogenetic tool with an extensive set of user-configurable modes to color residues.

 * View multiple sequence alignments.
 * Residues can be coloured by conservation, with user-configurable
   cutoffs and colours.
 * Residues can be coloured by residue type (user-configurable).
 * Colour schemes can be imported or exported.
 * Swissprot (or PIR) entries can be fetched by double clicking.
 * The position in the alignment can be easily tracked.
 * Manual deletion of rows and columns.
 * Automatic editing of rows and columns based on customisable criteria:
    - removal of all-gap columns;
    - removal of all gaps;
    - removal of redundant sequences;
    - removal of a column by a user-specified percentage of gaps;
    - filtering of sequences by percent identity;
    - removal of sequences by a user-specified percentage of gaps;
    - removal of partial sequences (those starting or ending with
      gaps); and
    - removal of columns by conservation (with user-specified
      upper/lower cutoffs).
 * The alignment can be saved in Stockholm, Selex, MSF or FASTA format.
 * Distance matrices between sequences can be generated using a variety
   of distance metrics.
 * Distance matrices can be imported or exported.
 * Phylogenetic trees can be constructed based on various distance-based
   tree reconstruction algorithms.
 * Trees can be saved in New Hampshire format.
 * Belvu can perform bootstrap phylogenetic reconstruction.

Етикети: Interface Toolkit: GTK

Пакети, предлагащи belvu

transitional package for belvu

Други пакети, свързани с belvu

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на belvu

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 202,6 кБ460,0 кБ [списък на файловете]
amd64 197,1 кБ396,0 кБ [списък на файловете]
arm64 188,7 кБ388,0 кБ [списък на файловете]
armel 180,3 кБ343,0 кБ [списък на файловете]
armhf 181,0 кБ295,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 196,1 кБ386,0 кБ [списък на файловете]
hurd-i386 206,6 кБ419,0 кБ [списък на файловете]
i386 206,4 кБ427,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-amd64 197,1 кБ392,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-i386 206,6 кБ419,0 кБ [списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура) 197,1 кБ407,0 кБ [списък на файловете]
mips 200,6 кБ458,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 201,3 кБ482,0 кБ [списък на файловете]
mipsel 202,3 кБ458,0 кБ [списък на файловете]
powerpcspe (неофициална архитектура) 195,3 кБ439,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 205,1 кБ504,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 204,9 кБ504,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 (неофициална архитектура) 191,9 кБ351,0 кБ [списък на файловете]
s390x 188,4 кБ412,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 210,9 кБ388,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 183,5 кБ397,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 197,3 кБ371,0 кБ [списък на файловете]