всички настройки
jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Източник: idba  ]

Пакет: idba (1.1.3-3)

Връзки за idba

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник idba.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

iterative De Bruijn Graph short read assemblers

IDBA stands for iterative de Bruijn graph assembler. In computational sequence biology, an assembler solves the puzzle coming from large sequencing machines that feature many gigabytes of short reads from a large genome.

This package provides several flavours of the IDBA assembler, as they all share the same source tree but serve different purposes and evolved over time.

IDBA is the basic iterative de Bruijn graph assembler for second-generation sequencing reads. IDBA-UD, an extension of IDBA, is designed to utilize paired-end reads to assemble low-depth regions and use progressive depth on contigs to reduce errors in high-depth regions. It is a generic purpose assembler and especially good for single-cell and metagenomic sequencing data. IDBA-Hybrid is another update version of IDBA-UD, which can make use of a similar reference genome to improve assembly result. IDBA-Tran is an iterative de Bruijn graph assembler for RNA-Seq data.

Други пакети, свързани с idba

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на idba

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 385,1 кБ2 951,0 кБ [списък на файловете]
amd64 371,8 кБ2 571,0 кБ [списък на файловете]
arm64 333,1 кБ2 191,0 кБ [списък на файловете]
armel 319,3 кБ2 199,0 кБ [списък на файловете]
armhf 329,5 кБ1 575,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 413,8 кБ2 863,0 кБ [списък на файловете]
hurd-i386 419,7 кБ2 823,0 кБ [списък на файловете]
i386 417,7 кБ2 831,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-amd64 371,1 кБ2 559,0 кБ [списък на файловете]
kfreebsd-i386 419,9 кБ2 819,0 кБ [списък на файловете]
mips 390,8 кБ3 238,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 387,0 кБ3 212,0 кБ [списък на файловете]
mipsel 402,8 кБ3 242,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 380,2 кБ3 227,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 381,4 кБ3 035,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 (неофициална архитектура) 370,8 кБ1 863,0 кБ [списък на файловете]
s390x 332,9 кБ2 703,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 309,3 кБ2 355,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 361,4 кБ2 319,0 кБ [списък на файловете]