Пакет: hmmer (3.4+dfsg-2 и други)

[ Източник: hmmer  ]

profile hidden Markov models for protein sequence analysis

HMMER is an implementation of profile hidden Markov model methods for sensitive searches of biological sequence databases using multiple sequence alignments as queries.

Given a multiple sequence alignment as input, HMMER builds a statistical model called a "hidden Markov model" which can then be used as a query into a sequence database to find (and/or align) additional homologues of the sequence family.

Етикети: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::searching, works-with-format::plaintext, Works with: Бази данни

Други пакети, свързани с hmmer

• dep: libc6 (>= 2.15) [hppa, m68k, sparc64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.19) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.15) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]

  fast suffix array construction

• sug: hmmer-doc (>= 3.1b2-1) [alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64]

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

  sug: hmmer-doc (>= 3.4+dfsg-2) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]

Изтегляне на hmmer

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	3.1b2-1	1 129,7 кБ	13 177,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	3.4+dfsg-2	1 037,5 кБ	6 466,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	3.4+dfsg-2	932,4 кБ	7 248,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	3.1b2-1	969,6 кБ	10 721,0 кБ	[списък на файловете]
i386	3.4+dfsg-2	1 068,1 кБ	6 187,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	3.1b2-1	850,4 кБ	8 566,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	3.4+dfsg-2	1 011,3 кБ	6 929,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	3.1b2-1	908,8 кБ	8 358,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	3.1b2-1	840,5 кБ	9 376,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	3.4+dfsg-2	1 049,1 кБ	6 365,0 кБ	[списък на файловете]