Пакет: r-bioc-singler (2.4.1+ds-1 и други)

[ Източник: r-bioc-singler  ]

BioConductor reference-based single-cell RNA-Seq annotation

Performs unbiased cell type recognition from single-cell RNA sequencing data, by leveraging reference transcriptomic datasets of pure cell types to infer the cell of origin of each single cell independently.

Други пакети, свързани с r-bioc-singler

• dep: libc6 (>= 2.32) [не alpha, ia64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.32) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 12) [x32]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: r-api-4.0

  виртуален пакет, предлаган от r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

  Пакетът не е наличен

• dep: r-api-bioc-3.18 [не x32]

  виртуален пакет, предлаган от r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-bioc-beachmat

  I/O for several formats storing matrix data

• dep: r-bioc-biocneighbors

  Nearest Neighbor Detection for Bioconductor Packages

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-biocsingular

  Singular Value Decomposition for Bioconductor Packages

• dep: r-bioc-delayedarray

  BioConductor delayed operations on array-like objects

• dep: r-bioc-delayedmatrixstats

  Functions on Rows and Columns of 'DelayedMatrix' Objects

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• dep: r-cran-matrix

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• rec: r-bioc-ensembldb

  GNU R utilities to create and use an Ensembl based annotation database

• rec: r-bioc-scater

  Single-Cell Analysis Toolkit for Gene Expression Data in R

• rec: r-bioc-scran

  BioConductor methods for single-cell RNA-Seq data analysis

• rec: r-bioc-singlecellexperiment

  S4 Classes for Single Cell Data

• rec: r-cran-pheatmap

  GNU R package to create pretty heatmaps

• rec: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

• sug: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-scater [не x32]

  Single-Cell Analysis Toolkit for Gene Expression Data in R

• sug: r-bioc-scran [не x32]

  BioConductor methods for single-cell RNA-Seq data analysis

• sug: r-bioc-scrnaseq

  Collection of Public Single-Cell RNA-Seq Datasets

• sug: r-bioc-scuttle

  BioConductor single-cell RNA-Seq analysis utilities

• sug: r-bioc-singlecellexperiment [не x32]

  S4 Classes for Single Cell Data

• sug: r-cran-ggplot2

  implementation of the Grammar of Graphics

• sug: r-cran-gridextra

  GNU R package with extensions for the grid package

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-pheatmap [не x32]

  GNU R package to create pretty heatmaps

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat [не x32]

  GNU R testsuite

• sug: r-cran-viridis

  GNU R package for color maps from matplotlib

Изтегляне на r-bioc-singler

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	2.4.1+ds-1	319,6 кБ	836,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	2.4.1+ds-1	326,9 кБ	795,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2.4.1+ds-1	311,7 кБ	771,0 кБ	[списък на файловете]
armel	2.4.1+ds-1	309,2 кБ	742,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	2.4.1+ds-1	309,4 кБ	654,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	2.4.1+ds-1	327,6 кБ	824,0 кБ	[списък на файловете]
i386	2.4.1+ds-1	334,9 кБ	801,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	2.4.1+ds-1	353,7 кБ	1 147,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	2.4.1+ds-1	310,4 кБ	861,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	2.4.1+ds-1	334,0 кБ	968,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	2.4.1+ds-1	331,7 кБ	899,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	2.4.1+ds-1	326,1 кБ	710,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	2.4.1+ds-1	333,9 кБ	843,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	2.4.1+ds-1	343,3 кБ	769,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	2.4.1+ds-1	304,9 кБ	1 419,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	2.0.0+ds-1	389,0 кБ	1 016,0 кБ	[списък на файловете]