Пакет: examl (3.0.22-5 и други)

[ Източник: examl  ]

Exascale Maximum Likelihood (ExaML) code for phylogenetic inference

Exascale Maximum Likelihood (ExaML) is a code for phylogenetic inference using MPI. This code implements the popular RAxML search algorithm for maximum likelihood based inference of phylogenetic trees.

ExaML is a strapped-down light-weight version of RAxML for phylogenetic inference on huge datasets. It can only execute some very basic functions and is intended for computer-savvy users that can write little perl-scripts and have experience using queue submission scripts for clusters. ExaML only implements the CAT and GAMMA models of rate heterogeneity for binary, DNA, and protein data.

ExaML uses a radically new MPI parallelization approach that yields improved parallel efficiency, in particular on partitioned multi-gene or whole-genome datasets. It also implements a new load balancing algorithm that yields better parallel efficiency.

It is up to 4 times faster than its predecessor RAxML-Light and scales to a larger number of processors.

Други пакети, свързани с examl

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [sparc64]

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.6) [x32]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [не x32]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

Изтегляне на examl

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	3.0.22-5	834,3 кБ	1 919,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	3.0.22-5	931,6 кБ	5 969,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	3.0.22-5	780,5 кБ	1 663,0 кБ	[списък на файловете]
armel	3.0.22-5	796,9 кБ	1 872,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	3.0.22-5	785,1 кБ	1 520,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	3.0.22-5	813,5 кБ	1 750,0 кБ	[списък на файловете]
i386	3.0.22-5	1 078,8 кБ	7 035,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	3.0.22-5	955,5 кБ	2 818,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	3.0.22-5	763,5 кБ	1 780,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	3.0.22-5	816,6 кБ	1 811,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	3.0.22-5	836,8 кБ	1 919,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	3.0.22-5	845,9 кБ	1 919,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	3.0.22-5	840,2 кБ	1 591,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	3.0.22-5	818,0 кБ	1 995,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	3.0.22-5	889,8 кБ	1 852,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	3.0.22-5	826,9 кБ	3 716,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	3.0.22-4	782,5 кБ	1 744,0 кБ	[списък на файловете]