Пакет: density-fitness (1.0.8-4 и други)

[ Източник: density-fitness  ]

Calculates per-residue electron density scores

The program density-fitness calculates electron density metrics, for main- (includes Cβ atom) and side-chain atoms of individual residues.

For this calculation, the program uses the structure model in either PDB or mmCIF format and the electron density from the 2mFo-DFc and mFo-DFc maps. If these maps are not readily available, the MTZ file and model can be used to calculate maps clipper. Density-fitness support both X-ray and electron diffraction data.

This program is essentially a reimplementation of edstats, a program available from the CCP4 suite. However, the output now contains only the RSR, SRSR and RSCC fields as in edstats with the addition of EDIAm and OPIA and no longer requires pre-calculated map coefficients.

Други пакети, свързани с density-fitness

• dep: libboost-date-time1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  set of date-time libraries based on generic programming concepts

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  Boost.Iostreams Library

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  program options library for C++

• dep: libboost-regex1.83.0-icu72 [sparc64]

  виртуален пакет, предлаган от libboost-regex1.83.0

• dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, hppa, ia64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libccp4c0 (>= 8.0.0) [sparc64]

  CCP4 core functionality - C runtime

• dep: libcifpp1 (>= 1.0.1) [hppa]

  Пакетът не е наличен

• dep: libcifpp5 (>= 5.0.7.1) [не hppa]

  Library files for libcifpp

• dep: libclipper2 (>= 2.1.20201109)

  object oriented library for crystallographic computing

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [sparc64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgslcblas0 (>= 2.7.1) [sparc64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package

• dep: libnewuoa0 (>= 0.1.2) [sparc64]

  Library file for libnewuoa

• dep: libpdb-redo1 (>= 1.0.2-3~) [hppa]

  Пакетът не е наличен

• dep: libpdb-redo3 (>= 3.0.5) [не hppa]

  Library file for libpdb-redo

• dep: libstdc++6 (>= 11) [не riscv64, sh4, sparc64]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64, sh4, sparc64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: libzeep5.1 (>= 5.1.4) [hppa]

  Library file for libzeep

  dep: libzeep5.1 (>= 5.1.8) [не hppa]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.2) [не hppa]

  compression library - runtime

Изтегляне на density-fitness

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.0.8-4	447,6 кБ	5 608,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.0.8-4	448,0 кБ	5 548,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.0.8-4	443,8 кБ	5 544,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.0.8-4	442,7 кБ	5 531,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.0.8-4	443,1 кБ	5 503,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1.0.0-4	104,9 кБ	359,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.0.8-4	452,0 кБ	5 554,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.0.8-4	461,7 кБ	5 675,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.0.8-4	444,3 кБ	5 542,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.0.8-4	447,9 кБ	5 615,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.0.8-4	449,3 кБ	5 610,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.0.8-4	449,9 кБ	5 608,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.0.8-4+b1	450,5 кБ	5 537,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.0.8-4	444,2 кБ	5 556,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.0.8-4	450,2 кБ	5 542,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.0.8-4+b1	443,8 кБ	6 445,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1.0.8-4	446,8 кБ	5 535,0 кБ	[списък на файловете]