всички настройки
stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  sid  ]
[ Източник: barrnap  ]

Пакет: barrnap (0.9+dfsg-2)

Връзки за barrnap

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник barrnap.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

rapid ribosomal RNA prediction

Barrnap (BAsic Rapid Ribosomal RNA Predictor) predicts the location of ribosomal RNA genes in genomes. It supports bacteria (5S,23S,16S), archaea (5S,5.8S,23S,16S), mitochondria (12S,16S) and eukaryotes (5S,5.8S,28S,18S).

It takes FASTA DNA sequence as input, and writes GFF3 as output. It uses the NHMMER tool that comes with HMMER 3.1 for HMM searching in RNA:DNA style. Multithreading is supported and one can expect roughly linear speed-ups with more CPUs.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::perl, interface::commandline, Role: Program, Purpose: use::searching, works-with::biological-sequence

Други пакети, свързани с barrnap

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на barrnap

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
all 199,3 кБ1 440,0 кБ [списък на файловете]