Пакет: macs (2.1.2.1-1)

[ Източник: macs  ]

Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

MACS empirically models the length of the sequenced ChIP fragments, which tends to be shorter than sonication or library construction size estimates, and uses it to improve the spatial resolution of predicted binding sites. MACS also uses a dynamic Poisson distribution to effectively capture local biases in the genome sequence, allowing for more sensitive and robust prediction. MACS compares favorably to existing ChIP-Seq peak-finding algorithms, is publicly available open source, and can be used for ChIP-Seq with or without control samples.

Други пакети, свързани с macs

• dep: cython

  C-Extensions for Python

• dep: libc6 (>= 2.15) [armhf]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.22) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [i386]

• dep: python

  interactive high-level object-oriented language (Python2 version)

  dep: python (<< 2.8)

  dep: python (>= 2.7~)

• dep: python-numpy

  Numerical Python adds a fast array facility to the Python language

Изтегляне на macs

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	2 397,2 кБ	5 551,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2 163,6 кБ	5 281,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	2 307,4 кБ	4 225,0 кБ	[списък на файловете]
i386	2 231,7 кБ	5 714,0 кБ	[списък на файловете]