Пакет: proteinortho (5.16.b+dfsg-1)

[ Източник: proteinortho  ]

Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis

Proteinortho is a stand-alone tool that is geared towards large datasets and makes use of distributed computing techniques when run on multi-core hardware. It implements an extended version of the reciprocal best alignment heuristic. Proteinortho was applied to compute orthologous proteins in the complete set of all 717 eubacterial genomes available at NCBI at the beginning of 2009. Authors succeeded identifying thirty proteins present in 99% of all bacterial proteomes.

Други пакети, свързани с proteinortho

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [i386]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [не armhf]

  GCC support library

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: python

  interactive high-level object-oriented language (Python2 version)

Изтегляне на proteinortho

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	139,9 кБ	292,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	137,0 кБ	276,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	134,9 кБ	255,0 кБ	[списък на файловете]
i386	141,2 кБ	287,0 кБ	[списък на файловете]