всички настройки
stretch-backports  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Източник: libedlib  ]

Пакет: edlib-aligner (1.2.4-1)

Връзки за edlib-aligner


Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник libedlib.


Външни препратки:

Подобни пакети:

edlib sequence alignment tool using edit distance

Edlib is a lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance. This package provides an aligner using this library.

Features of libedlib

 * Calculates edit distance (Levehnstein distance).
 * It can find optimal alignment path (instructions how to transform
   first sequence into the second sequence).
 * It can find just the start and/or end locations of alignment path -
   can be useful when speed is more important than having exact
   alignment path.
 * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and
   infix(HW), each of them useful for different scenarios.
 * You can extend character equality definition, enabling you to e.g.
   have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to
   work with degenerate nucleotides.
 * It can easily handle small or very large sequences, even when finding
   alignment path, while consuming very little memory.
 * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.

Други пакети, свързани с edlib-aligner

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на edlib-aligner

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
amd64 22,6 кБ65,0 кБ [списък на файловете]
arm64 21,4 кБ61,0 кБ [списък на файловете]
armel 19,6 кБ56,0 кБ [списък на файловете]
armhf 19,5 кБ48,0 кБ [списък на файловете]
i386 22,9 кБ68,0 кБ [списък на файловете]
mips 22,0 кБ61,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 22,1 кБ66,0 кБ [списък на файловете]
mipsel 22,2 кБ61,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 25,1 кБ85,0 кБ [списък на файловете]
s390x 21,8 кБ65,0 кБ [списък на файловете]