Пакет: sumaclust (1.0.36+ds-1)

[ Източник: sumaclust  ]

fast and exact clustering of genomic sequences

With the development of next-generation sequencing, efficient tools are needed to handle millions of sequences in reasonable amounts of time. Sumaclust is a program developed by the LECA. Sumaclust aims to cluster sequences in a way that is fast and exact at the same time. This tool has been developed to be adapted to the type of data generated by DNA metabarcoding, i.e. entirely sequenced, short markers. Sumaclust clusters sequences using the same clustering algorithm as UCLUST and CD- HIT. This algorithm is mainly useful to detect the 'erroneous' sequences created during amplification and sequencing protocols, deriving from 'true' sequences.

Други пакети, свързани с sumaclust

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.7) [не amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libsuma1 (>= 1.0.35)

  shared library for sumatra and sumaclust

Изтегляне на sumaclust

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	100,4 кБ	163,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	99,5 кБ	158,0 кБ	[списък на файловете]
armel	101,4 кБ	162,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	99,3 кБ	150,0 кБ	[списък на файловете]
i386	100,7 кБ	162,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	99,9 кБ	160,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	99,8 кБ	159,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	101,2 кБ	195,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	99,3 кБ	158,0 кБ	[списък на файловете]