Пакет: probalign (1.4-9)

[ Източник: probalign  ]

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities

Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% higher than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.

Други пакети, свързани с probalign

• dep: libc6 (>= 2.27)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, ppc64el]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ Library v3

Изтегляне на probalign

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	65,5 кБ	172,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	63,0 кБ	152,0 кБ	[списък на файловете]
armel	55,6 кБ	143,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	54,6 кБ	115,0 кБ	[списък на файловете]
i386	62,0 кБ	159,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	67,3 кБ	176,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	64,6 кБ	170,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	76,9 кБ	220,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	58,2 кБ	172,0 кБ	[списък на файловете]