Пакет: cat-bat (5.2.2-1)

Връзки за cat-bat

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник cat-bat.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

taxonomic classification of contigs and metagenome-assembled genomes (MAGs)

Contig Annotation Tool (CAT) and Bin Annotation Tool (BAT) are pipelines for the taxonomic classification of long DNA sequences and metagenome assembled genomes (MAGs/bins) of both known and (highly) unknown microorganisms, as generated by contemporary metagenomics studies. The core algorithm of both programs involves gene calling, mapping of predicted ORFs against the nr protein database, and voting-based classification of the entire contig / MAG based on classification of the individual ORFs. CAT and BAT can be run from intermediate steps if files are formatted appropriately.

Други пакети, свързани с cat-bat

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: diamond-aligner

accelerated BLAST compatible local sequence aligner
dep: prodigal

Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

Изтегляне на cat-bat

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	28,8 кБ	180,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	28,8 кБ	180,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	28,8 кБ	180,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	28,8 кБ	180,0 кБ	[списък на файловете]