Пакет: libbio-samtools-perl (1.43-3 и други)

[ Източник: libbio-samtools-perl  ]

Perl interface to SamTools library for DNA sequencing

Bio::SamTools provides a Perl interface to the libbam library for indexed and unindexed SAM/BAM sequence alignment databases. It provides support for retrieving information on individual alignments, read pairs, and alignment coverage information across large regions. It also provides callback functionality for calling SNPs and performing other base-by-base functions. Most operations are compatible with the BioPerl Bio::SeqFeatureI interface, allowing BAM files to be used as a backend to the GBrowse genome browser application.

Етикети: Software Development: Perl Development, Библиотеки, Implemented in: implemented-in::c, implemented-in::perl, Role: Development Library, Shared Library

Други пакети, свързани с libbio-samtools-perl

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl core perl modules

• dep: libc6 (>= 2.15) [не arm64, ppc64el]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

• dep: perl (>= 5.32.0-4)

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

• dep: perlapi-5.32.0

  виртуален пакет, предлаган от perl-base

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  compression library - runtime

• enh: gbrowse

  GMOD Generic Genome Browser

• enh: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Изтегляне на libbio-samtools-perl

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	1.43-3+b1	194,0 кБ	625,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.43-3+b1	184,1 кБ	609,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.43-3+b1	177,8 кБ	598,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.43-3+b1	177,7 кБ	490,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.43-3+b1	205,7 кБ	689,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.43-3+b1	181,3 кБ	682,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	1.43-3+b1	183,9 кБ	682,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.43-3+b1	204,0 кБ	821,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.43-3+b1	184,3 кБ	669,0 кБ	[списък на файловете]