Пакет: libjellyfish-2.0-dev (2.3.0-10)
Връзки за libjellyfish-2.0-dev
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник jellyfish.
Отговорници:
- Debian Med Packaging Team (Страница за QA, Пощенски архив)
- Shaun Jackman (Страница за QA)
- Andreas Tille (Страница за QA)
- Michael R. Crusoe (Страница за QA)
Външни препратки:
- Начална страница [www.cbcb.umd.edu]
Подобни пакети:
count k-mers in DNA sequences (development files of jellyfish)
JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.
JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.
This package contains the development files (static library and header files)
Други пакети, свързани с libjellyfish-2.0-dev
|
|
|
|
-
- dep: libjellyfish-2.0-2 (= 2.3.0-10)
- count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)
Изтегляне на libjellyfish-2.0-dev
Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
---|---|---|---|
amd64 | 134,3 кБ | 697,0 кБ | [списък на файловете] |
arm64 | 132,4 кБ | 688,0 кБ | [списък на файловете] |
armel | 129,1 кБ | 620,0 кБ | [списък на файловете] |
armhf | 129,3 кБ | 591,0 кБ | [списък на файловете] |
i386 | 141,6 кБ | 641,0 кБ | [списък на файловете] |
mips64el | 141,8 кБ | 789,0 кБ | [списък на файловете] |
ppc64el | 142,6 кБ | 740,0 кБ | [списък на файловете] |