Пакет: libfastahack-dev (1.0.0+dfsg-7)

[ Източник: libfastahack  ]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (devel)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This is the development package containing the statically linked library and the header files.

Етикети: Software Development: Библиотеки, Role: Development Library

Други пакети, свързани с libfastahack-dev

• dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-7)

  library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

Изтегляне на libfastahack-dev

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	26,4 кБ	120,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	25,4 кБ	115,0 кБ	[списък на файловете]
armel	27,5 кБ	110,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	27,8 кБ	98,0 кБ	[списък на файловете]
i386	29,2 кБ	105,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	29,2 кБ	143,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	30,1 кБ	114,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	28,0 кБ	127,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	25,0 кБ	119,0 кБ	[списък на файловете]