Пакет: tombo (1.5.1-4 и други)

[ Източник: tombo  ]

identification of modified nucleotides from raw nanopore sequencing data

Tombo is a suite of tools primarily for the identification of modified nucleotides from nanopore sequencing data. Tombo also provides tools for the analysis and visualization of raw nanopore signal.

Други пакети, свързани с tombo

• dep: cython3

  C-Extensions for Python 3

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: python3-pkg-resources

  Package Discovery and Resource Access using pkg_resources

• dep: python3-scipy

  scientific tools for Python 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)

Изтегляне на tombo

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	1.5.1-4+b1	418,2 кБ	1 419,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.5.1-4+b1	408,3 кБ	1 430,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.5.1-4+b1	411,0 кБ	1 382,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.5.1-4+b1	412,1 кБ	1 322,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.5.1-4+b1	423,6 кБ	1 435,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.5.1-4+b1	405,6 кБ	1 499,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	1.5.1-4+b1	412,4 кБ	1 426,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.5.1-4+b1	417,9 кБ	1 494,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.5.1-4+b1	406,3 кБ	1 410,0 кБ	[списък на файловете]