Пакет: probcons (1.12-14)

[ Източник: probcons  ]

PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

Tool for generating multiple alignments of protein sequences. Using a combination of probabilistic modeling and consistency-based alignment techniques, PROBCONS has achieved the highest accuracies of all alignment methods to date. On the BAliBASE benchmark alignment database, alignments produced by PROBCONS show statistically significant improvement over current programs, containing an average of 7% more correctly aligned columns than those of T-Coffee, 11% more correctly aligned columns than those of CLUSTAL W, and 14% more correctly aligned columns than those of DIALIGN.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Други пакети, свързани с probcons

• dep: libc6 (>= 2.27)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [не armel, armhf]

• sug: probcons-extra

  Extra programs from the probcons package

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Изтегляне на probcons

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	116,4 кБ	377,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	109,1 кБ	328,0 кБ	[списък на файловете]
armel	105,1 кБ	347,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	103,2 кБ	255,0 кБ	[списък на файловете]
i386	102,4 кБ	367,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	129,1 кБ	410,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	126,4 кБ	415,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	136,2 кБ	417,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	99,7 кБ	376,0 кБ	[списък на файловете]