Пакет: ggd-utils (1.0.0+ds-1 и други)

[ Източник: ggd-utils  ]

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Други пакети, свързани с ggd-utils

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

Изтегляне на ggd-utils

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	1.0.0+ds-1+b6	1 775,3 кБ	5 126,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.0.0+ds-1+b6	1 530,8 кБ	4 842,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.0.0+ds-1+b6	1 515,0 кБ	4 907,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.0.0+ds-1+b6	1 507,8 кБ	4 883,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.0.0+ds-1+b6	1 651,4 кБ	4 956,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.0.0+ds-1+b6	1 379,6 кБ	5 565,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	1.0.0+ds-1+b6	1 412,2 кБ	5 462,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.0.0+ds-1+b6	1 497,5 кБ	4 905,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.0.0+ds-1+b6	1 619,4 кБ	5 246,0 кБ	[списък на файловете]