Пакет: libjellyfish-2.0-2 (2.3.0-15 и други)

[ Източник: jellyfish  ]

count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)

JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.

JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.

This package contains the dynamic library the main executable of jellyfish is linked to.

Етикети: Role: Shared Library

Други пакети, свързани с libjellyfish-2.0-2

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ Library v3

Изтегляне на libjellyfish-2.0-2

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	2.3.0-15+b3	61,7 кБ	192,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2.3.0-15+b3	57,4 кБ	219,0 кБ	[списък на файловете]
armel	2.3.0-15+b3	53,1 кБ	163,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	2.3.0-15+b3	54,0 кБ	135,0 кБ	[списък на файловете]
i386	2.3.0-15+b3	68,8 кБ	195,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	2.3.0-15+b3	58,4 кБ	232,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	2.3.0-15+b3	67,4 кБ	284,0 кБ	[списък на файловете]