Пакунок: probcons (1.12-14)

[ Source: probcons  ]

PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

Tool for generating multiple alignments of protein sequences. Using a combination of probabilistic modeling and consistency-based alignment techniques, PROBCONS has achieved the highest accuracies of all alignment methods to date. On the BAliBASE benchmark alignment database, alignments produced by PROBCONS show statistically significant improvement over current programs, containing an average of 7% more correctly aligned columns than those of T-Coffee, 11% more correctly aligned columns than those of CLUSTAL W, and 14% more correctly aligned columns than those of DIALIGN.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Інші пакунки пов'язані з probcons

• dep: libc6 (>= 2.27)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [not armel, armhf]

• sug: probcons-extra

  Extra programs from the probcons package

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Завантажити probcons

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	116.4 kB	377.0 kB	[список файлів]
arm64	109.1 kB	328.0 kB	[список файлів]
armel	105.1 kB	347.0 kB	[список файлів]
armhf	103.2 kB	255.0 kB	[список файлів]
i386	102.4 kB	367.0 kB	[список файлів]
mips64el	129.1 kB	410.0 kB	[список файлів]
ppc64el	136.2 kB	417.0 kB	[список файлів]
s390x	99.7 kB	376.0 kB	[список файлів]