Пакунок: autodock (4.2.6-9)

[ Source: autodocksuite  ]

analysis of ligand binding to protein structure

AutoDock is a prime representative of the programs addressing the simulation of the docking of fairly small chemical ligands to rather big protein receptors. Earlier versions had all flexibility in the ligands while the protein was kept rather ridgid. This latest version 4 also allows for a flexibility of selected sidechains of surface residues, i.e., takes the rotamers into account.

The AutoDock program performs the docking of the ligand to a set of grids describing the target protein. AutoGrid pre-calculates these grids.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, works-with-format::TODO, Works with: 3D Model, Need an extra tag

Інші пакунки пов'язані з autodock

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [not armel, armhf, ppc64el]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• sug: autogrid

  pre-calculate binding of ligands to their receptor

Завантажити autodock

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	163.5 kB	411.0 kB	[список файлів]
arm64	150.7 kB	375.0 kB	[список файлів]
armel	156.7 kB	403.0 kB	[список файлів]
armhf	151.7 kB	315.0 kB	[список файлів]
i386	161.5 kB	411.0 kB	[список файлів]
mips64el	165.0 kB	460.0 kB	[список файлів]
ppc64el	164.4 kB	435.0 kB	[список файлів]
s390x	149.3 kB	395.0 kB	[список файлів]