[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  sid  ]
[ Source: tigr-glimmer  ]

Пакунок: tigr-glimmer (3.02-1)

Gene detection in archea and bacteria

Developed by the TIGR institute this software detects coding sequences in bacteria and archea.

Glimmer is a system for finding genes in microbial DNA, especially the genomes of bacteria and archaea. Glimmer (Gene Locator and Interpolated Markov Modeler) uses interpolated Markov models (IMMs) to identify the coding regions and distinguish them from noncoding DNA.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C++, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Searching, Supports Format: Plain Text

Інші пакунки пов'язані з tigr-glimmer

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
    also a virtual package provided by libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
    also a virtual package provided by libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1-21) [not arm, armel, hppa, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
    Допоміжна бібліотека GCC
    dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [hurd-i386]
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libgcc2 (>= 4.2.1-1) [m68k]
    Допоміжна бібліотека GCC
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1-21) [hppa]
    Допоміжна бібліотека GCC
  • dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [hurd-i386]
    Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
    dep: libstdc++6 (>= 4.2.1-4) [not armel, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    Бібліотека для визначення ланцюжка викликів програми — виконувана частина

Завантажити tigr-glimmer

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
alpha 468.0 kB1104 kB [список файлів]
amd64 438.2 kB944 kB [список файлів]
arm 384.4 kB731 kB [список файлів]
armel 399.8 kB840 kB [список файлів]
hppa 487.6 kB1004 kB [список файлів]
hurd-i386 386.0 kB856 kB [список файлів]
i386 386.7 kB860 kB [список файлів]
ia64 569.4 kB1484 kB [список файлів]
kfreebsd-amd64 (unofficial port) 437.4 kB852 kB [список файлів]
kfreebsd-i386 (unofficial port) 380.5 kB762 kB [список файлів]
m68k 385.4 kB836 kB [список файлів]
mips 450.9 kB1068 kB [список файлів]
mipsel 479.3 kB1188 kB [список файлів]
powerpc 457.3 kB968 kB [список файлів]
s390 415.5 kB876 kB [список файлів]
sparc 399.0 kB876 kB [список файлів]