[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  sid  ]
[ Source: seaview  ]

Пакунок: seaview (1:2.4-1)

Multiple sequence alignment editor

SeaView is a graphical multiple sequence alignment editor developed by Manolo Gouy. Multiple alignment formats (NEXUS, MSF, CLUSTAL, FASTA, PHYLIP, MASE) are supported for reading and writing. Alignments can be manually edited. The user is further supported by an integration of external programs, i.e., to run DOT-PLOT or MUSCLE, to locally improve the alignment.

When using SeaView for investigations that lead to a publication, please cite the following reference:

Galtier, N., Gouy, M. and Gautier, C. (1996) "SeaView and Phylo_win, two graphic tools for sequence alignment and molecular phylogeny." Comput. Applic. Biosci. 12:543-548.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, C++, User Interface: X Window System, Role: Program, Scope: Utility, Interface Toolkit: FLTK, Purpose: Editing, Printing, Supports Format: Plain Text, X Window System: Application

Інші пакунки пов'язані з seaview

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
    also a virtual package provided by libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
    also a virtual package provided by libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
  • dep: libfltk1.1 (>= 1.1.6) [not hurd-i386]
    Fast Light Toolkit - shared libraries
    dep: libfltk1.1 (>= 1.1.7-2) [hurd-i386]
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1-21) [not arm, armel, hppa, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
    Допоміжна бібліотека GCC
    dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [hurd-i386]
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libgcc2 (>= 4.2.1-1) [m68k]
    Допоміжна бібліотека GCC
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1-21) [hppa]
    Допоміжна бібліотека GCC
  • dep: libstdc++6 (>= 4.1.1-21) [not armel, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
    dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [hurd-i386]
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    Бібліотека для визначення ланцюжка викликів програми — виконувана частина
  • dep: libx11-6
    Клієнтська бібліотека X11
  • rec: xterm
    Емулятор терміналу для X
  • sug: clustalw
    global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
  • sug: muscle
    Multiple alignment program of protein sequences

Завантажити seaview

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
alpha 173.7 kB464 kB [список файлів]
amd64 151.7 kB400 kB [список файлів]
arm 146.6 kB384 kB [список файлів]
armel 144.5 kB380 kB [список файлів]
hppa 165.7 kB412 kB [список файлів]
hurd-i386 147.5 kB388 kB [список файлів]
i386 146.3 kB388 kB [список файлів]
ia64 216.1 kB616 kB [список файлів]
kfreebsd-amd64 (unofficial port) 152.4 kB354 kB [список файлів]
kfreebsd-i386 (unofficial port) 147.8 kB354 kB [список файлів]
m68k 140.4 kB380 kB [список файлів]
mips 166.2 kB480 kB [список файлів]
mipsel 166.5 kB480 kB [список файлів]
powerpc 162.9 kB424 kB [список файлів]
s390 153.3 kB400 kB [список файлів]
sparc 146.1 kB388 kB [список файлів]