[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Source: openbabel  ]

Пакунок: openbabel (2.2.0-2)

Chemical toolbox utilities

Open Babel is a chemical toolbox designed to speak the many languages of chemical data. It allows to search, convert, analyze, or store data from molecular modeling, chemistry, solid-state materials, biochemistry, or related areas. Features include: 

 * Hydrogen addition and deletion
 * Support for Molecular Mechanics
 * Support for SMARTS molecular matching syntax
 * Automatic feature perception (rings, bonds, hybridization, aromaticity)
 * Flexible atom typer and perception of multiple bonds from atomic coordinates
 * Gasteiger-Marsili partial charge calculation

File formats Open Babel supports include PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC and MPQC.

This package includes the following utilities: 

 * babel: Convert between various chemical file formats
 * obenergy: Calculate the energy for a molecule
 * obminimize: Optimize the geometry, minimize the energy for a molecule
 * obgrep: Molecular search program using SMARTS pattern
 * obprop: Print standard molecular properties
 * obfit: Superimpose two molecules based on a pattern
 * obrotamer: Generate conformer/rotamer coordinates
 * obchiral: Print molecular chirality information
 * obrotate: Rotate dihedral angle of molecules in batch mode

Tags: Field: Chemistry, Implemented in: C++, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Data Conversion

Інші пакунки пов'язані з openbabel

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, ia64]
    Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
    also a virtual package provided by libc6-udeb
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [not arm, armel, hppa]
    Допоміжна бібліотека GCC
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel]
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]
    Допоміжна бібліотека GCC
  • dep: libopenbabel3
    Chemical toolbox library
  • dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [not armel]
    Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    Бібліотека для визначення ланцюжка викликів програми — виконувана частина
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити openbabel

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
alpha 222.4 kB596 kB [список файлів]
amd64 222.3 kB580 kB [список файлів]
arm 219.9 kB524 kB [список файлів]
armel 210.6 kB516 kB [список файлів]
hppa 224.5 kB540 kB [список файлів]
i386 217.4 kB528 kB [список файлів]
ia64 246.0 kB704 kB [список файлів]
mips 214.5 kB560 kB [список файлів]
mipsel 217.4 kB560 kB [список файлів]
powerpc 242.6 kB616 kB [список файлів]
s390 218.8 kB528 kB [список файлів]
sparc 217.7 kB528 kB [список файлів]