Пакунок: amap-align (2.2-1)

Links for amap-align

Debian Resources:

Download Source Package amap-align:

Maintainers:

Debian-Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Charles Plessy (QA Page)
David Paleino (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [bio.math.berkeley.edu]

Similar packages:

Protein multiple alignment by sequence annealing

AMAP is a command line tool to perform multiple alignment of peptidic sequences. It utilizes posterior decoding, and a sequence-annealing alignment, instead of the traditional progressive alignment method. It is the only alignment program that allows to control the sensitivity / specificity tradeoff. It is based on the ProbCons source code, but uses alignment metric accuracy and eliminates the consistency transformation.

The java visualisation tool of AMAP 2.2 is not yet packaged in Debian.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C++, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Analysing, Comparing, Supports Format: Plain Text

Інші пакунки пов'язані з amap-align

depends

recommends

suggests

dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, ia64]

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1-21) [not arm, armel, hppa]

Допоміжна бібліотека GCC

dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel]
dep: libgcc4 (>= 4.1.1-21) [hppa]

Допоміжна бібліотека GCC
dep: libstdc++6 (>= 4.2.1-4) [not armel]

Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel]
dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]

Бібліотека для визначення ланцюжка викликів програми — виконувана частина

Завантажити amap-align

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha	162.6 kB	356 kB	[список файлів]
amd64	135.6 kB	324 kB	[список файлів]
arm	143.5 kB	273 kB	[список файлів]
armel	130.7 kB	304 kB	[список файлів]
hppa	157.9 kB	328 kB	[список файлів]
i386	124.4 kB	256 kB	[список файлів]
ia64	222.6 kB	568 kB	[список файлів]
mips	155.7 kB	384 kB	[список файлів]
mipsel	156.4 kB	384 kB	[список файлів]
powerpc	149.5 kB	316 kB	[список файлів]
s390	125.1 kB	304 kB	[список файлів]
sparc	131.5 kB	316 kB	[список файлів]