Пакунок: bwa (0.7.17-8~0exp and others)

Links for bwa

Debian Resources:

Download Source Package bwa:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Charles Plessy (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Carlos Borroto (QA Page)
Ognyan Kulev (QA Page)
Michael R. Crusoe (QA Page)

External Resources:

Homepage [bio-bwa.sourceforge.net]

Similar packages:

Експериментальний пакунок

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Tags: Biology: Proteins, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, interface::text-mode, role::program, Purpose: Analysing, Comparing

Інші пакунки пов'язані з bwa

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

rec: perl

Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)

sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Завантажити bwa

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	0.7.17-8~0exp	222.1 kB	577.0 kB	[список файлів]
amd64	0.7.17-8~0exp	207.2 kB	452.0 kB	[список файлів]
arm64	0.7.17-8~0exp	188.8 kB	448.0 kB	[список файлів]
armel	0.7.17-8~0exp	190.6 kB	431.0 kB	[список файлів]
armhf	0.7.17-8~0exp	190.1 kB	319.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	0.7.17-8~0exp	225.9 kB	512.0 kB	[список файлів]
i386	0.7.17-8~0exp	231.7 kB	523.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	0.7.17-8~0exp	291.1 kB	962.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	0.7.17-8~0exp	203.9 kB	471.0 kB	[список файлів]
mips64el	0.7.17-8~0exp	201.2 kB	527.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	0.7.17-8~0exp	216.9 kB	576.0 kB	[список файлів]
ppc64el	0.7.17-8~0exp	226.8 kB	576.0 kB	[список файлів]
riscv64	0.7.17-8~0exp+b1	214.5 kB	376.0 kB	[список файлів]
s390x	0.7.17-8~0exp	190.3 kB	464.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	0.7.17-8~0exp	272.9 kB	448.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	0.7.17-8~0exp	182.5 kB	1,092.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	0.7.17-8~0exp	218.3 kB	471.0 kB	[список файлів]