all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: bowtie  ]

Пакунок: bowtie (1.3.1-1 and others)

Links for bowtie

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package bowtie:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Ultrafast memory-efficient short read aligner

This package addresses the problem to interpret the results from the latest (2010) DNA sequencing technologies. Those will yield fairly short stretches and those cannot be interpreted directly. It is the challenge for tools like Bowtie to give a chromosomal location to the short stretches of DNA sequenced per run.

Bowtie aligns short DNA sequences (reads) to the human genome at a rate of over 25 million 35-bp reads per hour. Bowtie indexes the genome with a Burrows-Wheeler index to keep its memory footprint small: typically about 2.2 GB for the human genome (2.9 GB for paired-end).

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Наука: science::calculation, scope::utility, Purpose: Analysing, use::comparing, works-with::biological-sequence

Інші пакунки пов'язані з bowtie

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Завантажити bowtie

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Версія Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
amd64 1.3.1-1+b1 1,588.6 kB6,789.0 kB [список файлів]
arm64 1.3.1-1+b1 1,208.3 kB6,293.0 kB [список файлів]
mips64el 1.3.1-1+b1 1,049.6 kB8,197.0 kB [список файлів]
ppc64el 1.3.1-1+b1 1,390.6 kB8,277.0 kB [список файлів]
s390x 1.3.1-1+b1 1,315.8 kB6,745.0 kB [список файлів]