Paket: kalign (2.04-2)

[ Källkod: kalign  ]

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Muth-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment.

Märken: Biologi: Clustal/ALN, biology::format:fasta, Nucleic Acids, Proteiner, Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Comparing, Supports Format: Plain Text

Andra paket besläktade med kalign

• dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  Embedded GNU C Library: Shared libraries
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, i386, mips, mipsel]

  Embedded GNU C Library: Shared libraries
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]

  dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]

• dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]

  Embedded GNU C Library: Shared libraries
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

Hämta kalign

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	98,9 kbyte	288,0 kbyte	[filförteckning]
armel	104,5 kbyte	284,0 kbyte	[filförteckning]
i386	85,7 kbyte	264,0 kbyte	[filförteckning]
ia64	152,8 kbyte	532,0 kbyte	[filförteckning]
kfreebsd-amd64	98,8 kbyte	276,0 kbyte	[filförteckning]
kfreebsd-i386	85,9 kbyte	228,0 kbyte	[filförteckning]
mips	91,4 kbyte	308,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	92,1 kbyte	308,0 kbyte	[filförteckning]
powerpc	94,3 kbyte	280,0 kbyte	[filförteckning]
s390	93,7 kbyte	268,0 kbyte	[filförteckning]
sparc	81,9 kbyte	256,0 kbyte	[filförteckning]