[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Källkod: kalign  ]

Paket: kalign (2.04-2)

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Muth-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment.

Märken: Biologi: Clustal/ALN, biology::format:fasta, Nucleic Acids, Proteiner, Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Comparing, Supports Format: Plain Text

Andra paket besläktade med kalign

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, hppa, i386, mips, mipsel]
    GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
    också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]
    dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
  • dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]
    GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
    också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

Hämta kalign

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Paketstorlek Installerad storlek Filer
amd64 98,9 kbyte288 kbyte [filförteckning]
armel 104,5 kbyte284 kbyte [filförteckning]
hppa 93,7 kbyte264 kbyte [filförteckning]
i386 85,7 kbyte264 kbyte [filförteckning]
ia64 152,8 kbyte532 kbyte [filförteckning]
mips 91,4 kbyte308 kbyte [filförteckning]
mipsel 92,1 kbyte308 kbyte [filförteckning]
powerpc 94,3 kbyte280 kbyte [filförteckning]
s390 93,7 kbyte268 kbyte [filförteckning]
sparc 81,9 kbyte256 kbyte [filförteckning]