Paket: hmmer2 (2.3.2+dfsg-12)

[ Källkod: hmmer2  ]

profile hidden Markov models for protein sequence analysis

HMMER is an implementation of profile hidden Markov model methods for sensitive searches of biological sequence databases using multiple sequence alignments as queries.

Given a multiple sequence alignment as input, HMMER builds a statistical model called a "hidden Markov model" which can then be used as a query into a sequence database to find (and/or align) additional homologues of the sequence family.

Andra paket besläktade med hmmer2

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libsquid1t64 (>= 1.9g+cvs20050121)

  biosquid dynamic library for biological sequence analysis

• rec: biosquid

  utilities for biological sequence analysis

• sug: hmmer2-doc (>= 2.3.2+dfsg-12)

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

Hämta hmmer2

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	310,8 kbyte	2.462,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	307,0 kbyte	2.145,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	281,6 kbyte	2.387,0 kbyte	[filförteckning]
armel	269,3 kbyte	2.039,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	268,0 kbyte	1.607,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	293,3 kbyte	2.186,0 kbyte	[filförteckning]
i386	313,1 kbyte	2.455,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	335,7 kbyte	3.968,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	286,1 kbyte	1.925,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	304,6 kbyte	2.461,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	308,7 kbyte	2.965,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	308,2 kbyte	2.901,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	303,8 kbyte	1.864,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	301,5 kbyte	2.310,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	293,7 kbyte	2.258,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	272,8 kbyte	9.908,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	305,3 kbyte	2.099,0 kbyte	[filförteckning]