[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Källkod: openbabel  ]

Paket: openbabel (2.2.0-2)

Chemical toolbox utilities

Open Babel is a chemical toolbox designed to speak the many languages of chemical data. It allows to search, convert, analyze, or store data from molecular modeling, chemistry, solid-state materials, biochemistry, or related areas. Features include: 

 * Hydrogen addition and deletion
 * Support for Molecular Mechanics
 * Support for SMARTS molecular matching syntax
 * Automatic feature perception (rings, bonds, hybridization, aromaticity)
 * Flexible atom typer and perception of multiple bonds from atomic coordinates
 * Gasteiger-Marsili partial charge calculation

File formats Open Babel supports include PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC and MPQC.

This package includes the following utilities: 

 * babel: Convert between various chemical file formats
 * obenergy: Calculate the energy for a molecule
 * obminimize: Optimize the geometry, minimize the energy for a molecule
 * obgrep: Molecular search program using SMARTS pattern
 * obprop: Print standard molecular properties
 * obfit: Superimpose two molecules based on a pattern
 * obrotamer: Generate conformer/rotamer coordinates
 * obchiral: Print molecular chirality information
 * obrotate: Rotate dihedral angle of molecules in batch mode

Märken: Field: Chemistry, Implemented in: C++, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Data Conversion

Andra paket besläktade med openbabel

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • dep: libc6 (>= 2.7-1) [ej alpha, ia64]
    GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
    också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
    också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [ej arm, armel, hppa]
    GCC stödbibliotek
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel]
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]
    GCC stödbibliotek
  • dep: libopenbabel3
    Chemical toolbox library
  • dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [ej armel]
    GNUs Standard C++-bibliotek v3
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    Körtidsbibliotek för att bestämma programs anropskedjor
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta openbabel

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Paketstorlek Installerad storlek Filer
alpha 222,4 kbyte596 kbyte [filförteckning]
amd64 222,3 kbyte580 kbyte [filförteckning]
arm 219,9 kbyte524 kbyte [filförteckning]
armel 210,6 kbyte516 kbyte [filförteckning]
hppa 224,5 kbyte540 kbyte [filförteckning]
i386 217,4 kbyte528 kbyte [filförteckning]
ia64 246,0 kbyte704 kbyte [filförteckning]
mips 214,5 kbyte560 kbyte [filförteckning]
mipsel 217,4 kbyte560 kbyte [filförteckning]
powerpc 242,6 kbyte616 kbyte [filförteckning]
s390 218,8 kbyte528 kbyte [filförteckning]
sparc 217,7 kbyte528 kbyte [filförteckning]