Balík: garlic (1.6-3 a iné)

[ Zdroj: garlic  ]

program na vizualizáciu biomolekúl

Garlic je napísaný na vyšetrovanie membránových bielkovín. Je možné ho použiť na vizualizáciu iných bielkovín a tiež niektorých geometrických objektov. Táto verzia Garlic pozná formát PDB verzie 2.1. Garlic je možné použiť na analýzu bielkovinových sekvencií.

Závisí iba od knižníc X, nie sú potrebné žiadne iné knižnice.

Medzi jeho vlastnosti patria:

 * Pozícia a hrúbka platničiek (slab) sú viditeľné v malom okne.
 * Atómové väzby a farby väzieb v závislosti od polohy. Je dostupných päť

režimov mapovania (ako pri platničkách).

 * Schopný zobraziť stereoskopický obraz.
 * Schopný zobraziť iné geometrické objekty ako membrány.
 * Atómové informácie sú dostupné pre atóm, na ktorom sa nachádza kurzor

myši. Nie je potrebné klikať, len presunúť kurzor nad štruktúru.

 * Schopný načítať viac ako jednu štruktúru.
 * Schopný nakresliť Ramachandranov diagram, závitnicové koleso, Vennov

diagram, spriemerovanú hydrofóbnosť a hydrofobický moment.

 * Naspodku hlavného okna je k dispozícii príkazový riadok. Dokáže zobraziť

jednu chybovú správu a jeden reťazec príkazov.

Značky: Pole: Biológia, Chémia, User Interface: interface::commandline, interface::graphical, X Window System, Role: Program, Scope: scope::utility, uitoolkit::xlib, Purpose: Vizualizácia dát, X Window System: Aplikácia

Ostatné balíky súvisiace s balíkom garlic

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.28) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.28) [ia64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libx11-6

  X11 client-side library

• sug: garlic-doc

  [Chemistry] a molecular visualization program - documents

• sug: openbabel

  Chemical toolbox utilities (cli)

Stiahnuť garlic

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.6-3	231.8 kB	961.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.6-3+b1	218.3 kB	833.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.6-3	206.8 kB	776.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.6-3	200.0 kB	764.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.6-3	191.2 kB	596.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.6-3	205.2 kB	746.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.6-3	212.6 kB	868.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.6-3	263.8 kB	1,400.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.6-3	190.1 kB	740.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.6-3	213.1 kB	909.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.6-3	230.6 kB	984.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.6-3	257.4 kB	1,176.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.6-3+b1	230.4 kB	708.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.6-3	188.4 kB	788.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.6-3	259.7 kB	756.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.6-3	190.7 kB	787.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.6-3	216.5 kB	800.0 kB	[zoznam súborov]