Balík: nanopolish (0.11.0-2)
Odkazy pre nanopolish
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík nanopolish:
Správcovia:
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
consensus caller for nanopore sequencing data
Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom nanopolish
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.27)
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.3.1)
- podporná knižnica GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libhdf5-103
- HDF5 (Hierarchical Data Format 5) - dynamické súbory - sériová verzia
-
- dep: libhts2 (>= 1.4.1)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- štandardná knižnica C++ GNU v3
-
- dep: python
- interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (verzia python2)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- komprimačná knižnica - dynamická verzia
-
- rec: python-biopython
- knižnica na bioinformatiku implementovaná v jazyku Python 2
-
- rec: python-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)
Stiahnuť nanopolish
Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
---|---|---|---|
amd64 | 2,162.9 kB | 9,781.0 kB | [zoznam súborov] |