Balík: clustalw (2.1+lgpl-6)

[ Zdroj: clustalw  ]

globálne viacnásobné zarovnávanie sekvencií nukleotidov alebo peptidov

Tento program vykonáva viacnásobné zarovnávanie sekvencií nukleotidov alebo aminokyselín. Rozpoznáva formát vstupných sekvencií a či sú to nukleové kyseliny alebo (DNA/RNA) alebo aminokyseliny (bielkoviny). Môžete si vybrať z viacerých formátov viacnásobného zarovnania ako sú Phylip alebo FASTA. Clustal W je veľmi uznávaný.

Výstup programu Clustal W je možné ručne upravovať pomocou editora zarovnania ako je SeaView alebo jeho sprievodný program Clustal X. Pro zostavovaní modelu z vášho zarovnania je možné ho použiť na vylepšené vyhľadávanie v databáze. Balík Debianu hmmer vytvára takúto formu HMM.

Značky: Biológia: Clustal/ALN, Proteins, Pole: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementované v: implemented-in::c++, interface::commandline, User Interface: Text-based Interactive, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Porovnávanie, Supports Format: works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Ostatné balíky súvisiace s balíkom clustalw

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [nie armhf]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• sug: clustalx

  balík na viacnásobné zarovnávanie sekvencií nukleových kyselín a bielkovín - grafické rozhranie

• sug: seaview

  multiplatformné rozhranie na zarovnanie sekvencií a fylogenetiku

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: emboss

  európsky balík otvoreného softvéru pre molekulárnu biológiu

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Stiahnuť clustalw

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	275.2 kB	775.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	250.4 kB	722.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	243.1 kB	522.0 kB	[zoznam súborov]
i386	294.1 kB	834.0 kB	[zoznam súborov]